Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CochQ62507 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms