Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ss18Q62280 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18Q62280 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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