Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrmsQ62270 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SrmsQ62270 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SrmsQ62270 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrmsQ62270 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms