Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Six2Q62232 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six2Q62232 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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