Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sema5aQ62217 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms