Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ssr4Q62186 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ssr4Q62186 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ssr4Q62186 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ssr4Q62186 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ssr4Q62186 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ssr4Q62186 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssr4Q62186 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms