Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms