Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Foxj1Q61660 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Foxj1Q61660 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxj1Q61660 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxj1Q61660 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms