Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
EsrrbQ61539 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EsrrbQ61539 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EsrrbQ61539 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EsrrbQ61539 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EsrrbQ61539 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EsrrbQ61539 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EsrrbQ61539 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EsrrbQ61539 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EsrrbQ61539 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EsrrbQ61539 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms