Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nab1Q61122 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nab1Q61122 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nab1Q61122 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nab1Q61122 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nab1Q61122 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nab1Q61122 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nab1Q61122 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nab1Q61122 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nab1Q61122 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nab1Q61122 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nab1Q61122 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nab1Q61122 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nab1Q61122 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nab1Q61122 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms