Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Foxd3Q61060 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Foxd3Q61060 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Foxd3Q61060 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Foxd3Q61060 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Foxd3Q61060 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Foxd3Q61060 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Foxd3Q61060 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Foxd3Q61060 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Foxd3Q61060 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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