Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms