Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms