Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms