Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms