Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim38Q5SZ99 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim38Q5SZ99 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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