Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf215Q5SPX3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf215Q5SPX3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms