Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trdv4Q5R1A3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trdv4Q5R1A3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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