Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RilpQ5ND29 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RilpQ5ND29 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms