Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Slc38a8Q5HZH7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc38a8Q5HZH7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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