Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms