Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms