Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrig2Q52KR2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.3 ms