Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms