Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Snhg11Q4G0K9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Snhg11Q4G0K9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Snhg11Q4G0K9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snhg11Q4G0K9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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