Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srbd1Q497V5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srbd1Q497V5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms