Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmub2Q3V209 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmub2Q3V209 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms