Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccdc185Q3V118 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccdc185Q3V118 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccdc185Q3V118 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccdc185Q3V118 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccdc185Q3V118 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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