Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrc43Q3V0L5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrc43Q3V0L5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrc43Q3V0L5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Lrrc43Q3V0L5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Lrrc43Q3V0L5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms