Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms