Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVR3

Ttbk2, Tau-tubulin kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk2Q3UVR3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttbk2Q3UVR3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms