Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms