Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms