Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TceancQ3US16 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TceancQ3US16 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms