Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms