Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sec31aQ3UPL0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sec31aQ3UPL0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sec31aQ3UPL0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sec31aQ3UPL0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec31aQ3UPL0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec31aQ3UPL0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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