Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp3Q3ULW8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp3Q3ULW8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms