Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms