Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3UJP5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3UJP5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms