Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b2Q3UJB0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b2Q3UJB0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms