Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms