Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms