Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms