Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll12Q3UDE2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll12Q3UDE2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll12Q3UDE2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttll12Q3UDE2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms