Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms