Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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