Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf40Q3U319 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Rnf40Q3U319 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf40Q3U319 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf40Q3U319 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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