Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms