Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms