Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1lQ3TTP0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms